減排成本可知性：

減排成本的可知性決定了經濟主體的遵從成本。在成本可知或可預測時，經濟主體就能夠合理地安排其生產并優化其投資決策，反之，企業因為顧慮，會選擇一些次優方案，從而加大整個經濟運行的成本。一般認為，碳稅是達到既定成本最小的減排政策工具。因為碳稅具有固定性和法律性，企業可以根據碳稅制度，依照自身情況選擇最優的減排路徑。而碳交易中排放價格由于市場原因，會有較大的波動性，這樣會增加企業的遵從成本。而減少此波動性，只能依靠市場制度的完善和市場主體自身意識的提高，故碳交易的減排成本有較大的不確定性。

管理成本：

各國碳稅的征收一般是依據各國稅制自身的體系，比如可以利用消費稅體系，在石化能源的產生環節，進口環節征收消費稅。因此碳稅實際就是增加消費稅的稅目，并調整相應稅目的稅率，碳稅的管理成本較低。而對于碳排放交易來說，初始排放權的分配，由于各方利益的博弈，需要經過一個較長時期的談判，且還需要建立相應的排放權交易市場以及建立參與企業能源使用的報告機制、監控機制與懲罰機制，這些都需要較大的額外管理成本。不過也正是因為碳市場的建立，產生了一個新的行業，增加了較多的就業崗位，創造出巨大的經濟價值，結果管理成本與經濟效益一起遞增。從這個角度來看，管理成本的提高并不意味著有較大的劣勢。