碳金融制度交易機制發(fā)生的交易費用主要包括搜尋價格、達成協(xié)議、保障合約實施以及違約費用等。碳金融制度試圖利用市場機制實現(xiàn)碳減排資源的優(yōu)化配置，其核心目標本身為交易費用最小化，但是因為宏觀經(jīng)濟環(huán)境的變化、市場壟斷勢力的影響以及非法行為猖獗等因素影響，致使我國碳金融制度交易機制的交易費用昂貴。碳金融市場中的非法合同使CDM 市場變化難以預(yù)計，極具脆弱性，對將來碳金融市場規(guī)則的制定也會產(chǎn)生影響，進而導(dǎo)致碳交易風(fēng)險與費用劇增。

       我國碳交易市場雖然為數(shù)眾多但是交易清淡，截至目前，我國同類的環(huán)境權(quán)益交易所已經(jīng)多達20多家，但其主要功能均為CDM 項目的撮合與節(jié)能環(huán)保技術(shù)的轉(zhuǎn)讓交易，大部分的碳交易都在場外進行，能夠真正實現(xiàn)場內(nèi)交易的寥寥無幾，各地交易所大都面臨有價無市的尷尬。同時，眾多交易所林立的局面無形中增加了買賣雙方的信息成本和交易成本，各個交易所采用的核證標準也不盡相同，在進行國際碳議價時難以形成統(tǒng)一的聲音，進而削弱了我國在國際碳市場議價的能力。

       碳金融是一種新型的創(chuàng)新性金融，存在諸如政策風(fēng)險等諸多不確定風(fēng)險，涉及跨境交易等諸多不同的專業(yè)領(lǐng)域，如清潔發(fā)展機制CDM 交易領(lǐng)域，國際上一般由商業(yè)銀行等金融機構(gòu)為碳金融交易提供專業(yè)的咨詢服務(wù)，而我國在這方面沒有足夠的市場經(jīng)驗，也缺乏相關(guān)的人才儲備，使得中介服務(wù)市場質(zhì)量不高，抑制了碳金融的發(fā)展。

        我國主要通過CDM 項目參與碳金融活動的原因是，我國能源結(jié)構(gòu)以煤炭為主，能源利用效率低，減排潛力巨大。而發(fā)達國家則把原始的廉價的CER產(chǎn)品，通過相關(guān)金融機構(gòu)的包裝，設(shè)計為價格更高、更復(fù)雜的碳金融衍生產(chǎn)品和擔保產(chǎn)品并進行出售，以獲取更大的收益。比如，2008 年，寶鋼公司以10歐元/噸的價格向英國瑞碳公司瑞士信貸集團出售碳排放量，美國國際集團（ALG）以6.5 美元/噸的價格向四川和新疆購買碳排放量，而與此同時，荷蘭和世界銀行進行碳交易的碳排放量價格已經(jīng)達到了23.15 歐元/噸。由此可以看出，盡管我國是CER 最大的供應(yīng)國，由于企業(yè)對CDM 國際規(guī)則及盈利模式缺乏深入的了解，以至于失去了相應(yīng)的權(quán)重地位，失去了對項目交易價格發(fā)言權(quán)，在整個碳交易產(chǎn)業(yè)鏈中只能處于低端。