碳排放權注冊登記簿系統,或者稱之為碳排放配額賬戶管理系統,是碳交易體系的“心臟”,與股權簿記系統相似,主要是記載并確認碳排放配額持有人對配額的所有權及其相關權益的產生、變更、消滅的法律憑證。合理設計登記管理制度是交易順利進行的重要保障,也是政府掌握排放權及其變化情況的基本途徑。應當區分碳排放權初始登記、變更登記、注銷登記的不同情形和程序,按照碳排放管控單位與普通投資者等不同市場主體分別進行登記管理,并嚴格限制注冊登記簿系統的使用管理權限,確保配額持有人的合法權益。此外,還應該研究通過法律授權等方式,使碳交易主管部門能夠在緊急情況下采取凍結賬戶等措施,確保市場交易安全。