2013年11月19日，北京市發改委發布《關于發放2013年碳排放配額的通知》（以下簡稱“通知”），稱已經將碳交易試點納入的各有關單位2013年既有設施的碳排放配額分配至其配額賬戶，分配依據是經市政府審定的配額核定方法（已在北京市碳排放權注冊登記簿公布）及各有關單位的碳排放核查報告中的數據。各有關單位可于11月19日14：00—23日18：00登陸北京市碳排放權注冊登記薄系統查詢。配額分配的完成意味著北京碳交易試點已經為啟動做好準備，按照目前的工作安排啟動日期定于11月28日。
根據通知，北京試點企業（單位）年度碳排放配額總量包括既有設施配額、新增設施配額、配額調整量三部分。除了既有設施配額已經發放以外，新增設施配額及配額調整量將于明年5月初，在完成各單位2013年碳排放核算及核查工作后發放。
據北京市配額核定方法，北京市新增設施二氧化碳排放配額按所屬行業的二氧化碳排放強度先進值進行核定，即配額數量等于行業
碳強度先進值乘以新增設施的活動水平（產量/產值/建筑面積等）。行業碳強度先進值取值另行公布。
對于配額調整，北京市的規定是“如果提出了配額變更申請，市主管部門對有關情況進行核實，確有必要的，在次年履約期前參考
第三方核查機構的審定結論，對排放配額進行相應調整，多退少補”。即配額調整基于企業自愿申請，這與
深圳由主管部門進行配額調整的規則略有區別。
對企業（單位）的配額按照“分別核定、分別發放”的原則核定發放。每年6月30日前，發放企業（單位）本年度既有設施二氧化碳排放配額；次年履約期前，在完成企業（單位）二氧化碳排放核查后，核定并發放企業（單位）新增二氧化碳排放配額；次年履約期前，在審定企業（單位）提出的配額變更申請后，核定發放配額調整量。
北京市既有設施的配額分配方法按照行業不同分為兩種，即火力、
電力行業與其它行業。
首先，2013年1月1日之前投運的制造業、其他工業和服務業企業（單位），基于歷史排放總量（2009-2012平均值）的配額核定方法分配配額。配額數量等于歷史排放總量乘以控排系數（即“行業年度調整系數”）。
其次，供熱企業（單位）和火力發電企業在2013年1月1日之前已投入運行的排放設施（機組），基于歷史排放強度（2009-2012平均值）的配額核定方法分配配額。供電部分的配額數量等于供電歷史排放強度乘以核定年份設施的供電量再乘以控排系數，供熱部分的配額數量等于供熱歷史排放強度乘以核定年份設施的供熱量再乘以控排系數。熱電聯產企業的配額數量等于供電配額數量與供熱配額數量之和。
各行業的控排系數，即各行業的行業年度調整系數，代表對該行業每年的控排要求。如下表所示，2013-2015年，制造業和其它工業企業每年配額遞減2%，服務業企業每年遞減1-2%，燃氣設施控排系數不降低，發電和供熱的燃煤設施則三年共分別降低0.5%和1%。
北京市碳排放權交易試點各行業年度控排系數
