這套體系的形成體現(xiàn)了歐盟的行政特點(diǎn)。作為以主權(quán)國(guó)家為成員的地區(qū)一體化組織，歐盟所有的立法、指令都要通過(guò)成員國(guó)貫徹才能推行。歐盟要做出減排承諾，內(nèi)部不是強(qiáng)制所有成員國(guó)減排，而是通過(guò)平衡達(dá)到整體承諾，如歐盟允許西班牙等過(guò)在一定期限內(nèi)甚至可以增加排放量，以維持經(jīng)濟(jì)增長(zhǎng)和國(guó)內(nèi)產(chǎn)業(yè)保護(hù)。

在制定溫室氣體排放交易配額的過(guò)程中，歐盟也考慮到不同成員國(guó)的現(xiàn)實(shí)情況和整體政策的可行性。在西歐成員國(guó)中，環(huán)保技術(shù)得到了廣泛應(yīng)用，實(shí)現(xiàn)減排成本較低;而在中東歐和南歐部分成員國(guó)中，大型工業(yè)產(chǎn)業(yè)仍依賴(lài)于高排放技術(shù)，整體改造的成本較高。

基于這種背景，歐盟在創(chuàng)建碳排放交易體系過(guò)程中主要采取的方法是成員國(guó)申報(bào)，委員會(huì)批準(zhǔn)的模式。即成員國(guó)根據(jù)自身情況綜合內(nèi)部產(chǎn)業(yè)情況制定國(guó)家年度排放配額，再提交委員會(huì)環(huán)境和能源部門(mén)進(jìn)行討論。

在聯(lián)盟層次上，歐盟根據(jù)國(guó)際減排承諾、聯(lián)盟減排計(jì)劃等標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行審批。體系啟動(dòng)年度分配到相關(guān)國(guó)家的配額將略少于預(yù)計(jì)排放量，而且之后每年的配額將按減排計(jì)劃不斷減少，配額交易以年度進(jìn)行結(jié)算并清零，產(chǎn)生供求需要，創(chuàng)建聯(lián)盟層面的配額交易市場(chǎng)。該體系為聯(lián)盟統(tǒng)一政策，一旦實(shí)施，國(guó)家將無(wú)權(quán)自主改變配額或重新調(diào)整行業(yè)間配額的分配。

對(duì)于大型利益集團(tuán)，特別涉及成員國(guó)國(guó)家利益的能源與工業(yè)部門(mén)，歐盟為緩解阻力在體系運(yùn)行開(kāi)始時(shí)使用免費(fèi)贈(zèng)予企業(yè)配額的方式，逐步增加大型污染企業(yè)購(gòu)買(mǎi)配額的壓力。