碳商品是一種虛擬產品，它的制造過程非常特殊，成本無法事先確定，只有在完全競爭的市場條件下，通過場內交易的方式來定價。但配額市場是基于強制配額產生的市場，不是完全自由的市場。每個配額交易系統都會產生一個價格，這個價格與本國的減排成本直接相關，代表了一個國家或地區愿意購買的外部減排指標的最高出價，所以各國的配額價格通常也是不同的。由此，碳減排量的定價便存在著困難。主流的定價方式像CDM一樣參考歐盟溫室氣體排放交易體系(EUETS)或其他交易平臺的二級市場價格，同時結合場外的議價。另一種方式是采用場內交易，自動生成價格。但無論怎樣，都會帶來同樣的結果：減排量總是流向價格最高的配額交易系統。