生態系統是各種生物體和其他自然資源復雜交織相互依存的網絡，各種生態系統提供諸如食物、飲用及灌溉用水、傳授花粉和氣候調節等寶貴服務，在實現人類 福祉和驅動經濟增長方面起著至關重要的作用。然而，人類社會已經對這些天然環境造成了系統性地破壞，威脅著諸如森林、耕地、江河等生態系統，就像它們取之不盡用之不竭一樣。由于氣候變化的影響開始呈現，改變了天氣模并對生態系統造成更大壓力，因而對這些自然資源進行可持續管理將變得比以往還要重要得多。

若沒有良好的生態系統，2015年后可持續發展議程就無法實現。環境署協助各政府確保其生態系統受到保護和可持續管理，以確保長期維持對人類福祉和經濟增長而言至關重要的生態系統服務。

在全球層面，聯合國環境規劃署金融行動計劃與43個金融機構展開合作，它們所管理的資產超過6.4萬億美元。通過簽署《自然資本宣言》，這些金融機構承諾，為將自然資本標準整合進產品與服務而作出努力。在共計代表著全球15%保費收入和9萬億美元管理資產的保險公司支持下，《聯合國環境規劃署金融行動計劃：保險業促進可持續發展原則》(UNEP FI Principles for Sustainable Insurance Initiative)正在開展一個全球性項目，旨在建設對氣候和災害有適應力的社區和經濟，在人造基礎設施建設的同時強調自然生態系統在減少暴風、地震和洪水風險中的作用。

為支持保護物種及生態系統的努力，環境署積極開展研究并提供工具，其中一項舉措是2014年2月新推的一項在線行動計劃。環境署作為合作伙伴之一參與的全球森林觀察是一個動態森林監測與預警系統，它采用衛星技術、開放數據和眾包方式扼制毀林和更廣泛的生物多樣性損失。